当然，在发展的过程中也不可避免存在很多问题：如物流业务需求量小，尚未达到规模效益的要求；物流服务的水平还需要进一步提高；保税区内外的物流网络缺乏有效衔接；保税仓储设施条件不能满足国际物流发展的需要等等这些问题阻碍了保税区国际物流的进一步发展，影响国际物流功能在我国保税仓储的充分发挥。   

    我们必须高度重视，并采取措施解决这些问题，我们可以通过流程再造，通过简化、同步、自动化等方法；规模经济；新技术应用等手段来解决目前存在的问题。当然，除了上述的解决途径（包括技术和制度创新）之外，还要强调的是人才优势与专业化的社会定位。 

    我们可以充分利用剩余的库房设备开展加工包装、物资配送，形成比较系统的第三方物流，而后，在发展过程中与社会上功能性物流企业密切合作，开展综合物流代理，形成一个社会上有规模、有实力、有信誉的物流企业。当然，仓储物流企业走出误区，利用丰富的库场设施及管理经验，形成第三方物流，到探索适合国情的综合物流代理，除了具有一定的环境资源外，管理上的创新是必不可少的。 

    对于保税仓储物流服务而言，在全球经济一体化、贸易自由化的大环境下，对外贸易、跨国生产和制造体系全球化将进一步发展，并带动国际物流的迅速发展，相应保税物流作为国际物流的接力区，其发展必将在国际物流及国内物流的推动下，由被动变主动、由管理变服务，成为推动我国对外贸易、加工贸易深层次发展的重要因素。